Делается это просто, проверено на CentOS 5
Заходите на сервер в консоль сервера используя SSH (например putty) под рутом (root)
1. Редактируем файл /etc/sysconfig/network
# vi /etc/sysconfig/network
в строке NETWORKING_IPV6=yes
меняем на no
NETWORKING_IPV6=no
2. Редактируем файл /etc/modprobe.conf
# vi /etc/modprobe.conf
в этот файл добавляем следующие строки
alias ipv6 off
alias net-pf-10 off
3. Останавливаем сервис ipv6tables
# service ip6tables stop
отключаем с автозапуска
# chkconfig ip6tables off
4. После этих изменений перезапускаем сервер
# reboot
На сайте CentOS это процесс описан, если не получилось, попробуйте другой вариант, который указан на сайте CentOS : http://wiki.centos.org/FAQ/CentOS5
